Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ETFBP38117 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ETFBP38117 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ETFBP38117 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ETFBP38117 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETFBP38117 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETFBP38117 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETFBP38117 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ETFBP38117 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETFBP38117 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETFBP38117 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ETFBP38117 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETFBP38117 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETFBP38117 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETFBP38117 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFBP38117 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFBP38117 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFBP38117 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFBP38117 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFBP38117 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFBP38117 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFBP38117 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFBP38117 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFBP38117 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFBP38117 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFBP38117 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFBP38117 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETFBP38117 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ETFBP38117 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETFBP38117 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ETFBP38117 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ETFBP38117 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ETFBP38117 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ETFBP38117 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ETFBP38117 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETFBP38117 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETFBP38117 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ETFBP38117 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETFBP38117 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ETFBP38117 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETFBP38117 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETFBP38117 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETFBP38117 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETFBP38117 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETFBP38117 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ETFBP38117 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ETFBP38117 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ETFBP38117 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ETFBP38117 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ETFBP38117 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ETFBP38117 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ETFBP38117 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ETFBP38117 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETFBP38117 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETFBP38117 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETFBP38117 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETFBP38117 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ETFBP38117 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETFBP38117 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETFBP38117 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETFBP38117 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETFBP38117 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETFBP38117 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETFBP38117 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETFBP38117 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETFBP38117 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETFBP38117 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFBP38117 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFBP38117 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFBP38117 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFBP38117 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFBP38117 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFBP38117 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFBP38117 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFBP38117 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFBP38117 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETFBP38117 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETFBP38117 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETFBP38117 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ETFBP38117 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETFBP38117 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETFBP38117 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETFBP38117 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFBP38117 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFBP38117 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFBP38117 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFBP38117 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFBP38117 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFBP38117 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFBP38117 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETFBP38117 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETFBP38117 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETFBP38117 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETFBP38117 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETFBP38117 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETFBP38117 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETFBP38117 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETFBP38117 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ETFBP38117 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ETFBP38117 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms