Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX5P35711 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX5P35711 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX5P35711 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX5P35711 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX5P35711 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX5P35711 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX5P35711 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX5P35711 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX5P35711 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX5P35711 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX5P35711 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX5P35711 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX5P35711 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX5P35711 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX5P35711 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX5P35711 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX5P35711 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX5P35711 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX5P35711 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX5P35711 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX5P35711 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX5P35711 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX5P35711 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX5P35711 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX5P35711 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX5P35711 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX5P35711 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX5P35711 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX5P35711 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX5P35711 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX5P35711 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX5P35711 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX5P35711 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX5P35711 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX5P35711 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX5P35711 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX5P35711 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX5P35711 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX5P35711 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX5P35711 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX5P35711 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX5P35711 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX5P35711 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX5P35711 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX5P35711 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX5P35711 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX5P35711 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX5P35711 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX5P35711 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX5P35711 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX5P35711 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX5P35711 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX5P35711 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX5P35711 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX5P35711 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX5P35711 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX5P35711 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX5P35711 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX5P35711 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX5P35711 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX5P35711 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX5P35711 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX5P35711 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX5P35711 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX5P35711 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX5P35711 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX5P35711 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX5P35711 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX5P35711 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX5P35711 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX5P35711 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX5P35711 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX5P35711 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX5P35711 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX5P35711 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX5P35711 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX5P35711 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX5P35711 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX5P35711 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX5P35711 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX5P35711 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX5P35711 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX5P35711 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX5P35711 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX5P35711 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX5P35711 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX5P35711 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX5P35711 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX5P35711 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SOX5P35711 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX5P35711 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX5P35711 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX5P35711 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX5P35711 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX5P35711 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX5P35711 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX5P35711 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX5P35711 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX5P35711 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.7 ms