Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYLC1P35663 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms