Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA4P35212 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA4P35212 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA4P35212 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA4P35212 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA4P35212 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA4P35212 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA4P35212 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA4P35212 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA4P35212 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA4P35212 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA4P35212 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA4P35212 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJA4P35212 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA4P35212 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA4P35212 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA4P35212 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA4P35212 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA4P35212 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA4P35212 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA4P35212 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA4P35212 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA4P35212 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA4P35212 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA4P35212 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA4P35212 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA4P35212 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA4P35212 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA4P35212 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA4P35212 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA4P35212 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA4P35212 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA4P35212 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA4P35212 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA4P35212 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA4P35212 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA4P35212 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA4P35212 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA4P35212 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA4P35212 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA4P35212 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA4P35212 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA4P35212 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA4P35212 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA4P35212 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA4P35212 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA4P35212 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA4P35212 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA4P35212 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA4P35212 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA4P35212 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA4P35212 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA4P35212 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA4P35212 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA4P35212 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA4P35212 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA4P35212 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA4P35212 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA4P35212 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA4P35212 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA4P35212 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA4P35212 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA4P35212 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA4P35212 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA4P35212 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA4P35212 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA4P35212 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA4P35212 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA4P35212 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA4P35212 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA4P35212 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA4P35212 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA4P35212 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA4P35212 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA4P35212 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA4P35212 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA4P35212 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA4P35212 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA4P35212 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA4P35212 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA4P35212 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA4P35212 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA4P35212 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA4P35212 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA4P35212 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA4P35212 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA4P35212 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA4P35212 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA4P35212 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA4P35212 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA4P35212 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA4P35212 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA4P35212 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA4P35212 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA4P35212 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA4P35212 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA4P35212 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA4P35212 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA4P35212 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA4P35212 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms