Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYP2C19P33261 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CYP2C19P33261 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYP2C19P33261 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYP2C19P33261 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP2C19P33261 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYP2C19P33261 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP2C19P33261 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP2C19P33261 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP2C19P33261 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP2C19P33261 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP2C19P33261 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CYP2C19P33261 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CYP2C19P33261 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYP2C19P33261 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP2C19P33261 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms