Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSP1P33241 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSP1P33241 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSP1P33241 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSP1P33241 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSP1P33241 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSP1P33241 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSP1P33241 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSP1P33241 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSP1P33241 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSP1P33241 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSP1P33241 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSP1P33241 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSP1P33241 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSP1P33241 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSP1P33241 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSP1P33241 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSP1P33241 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSP1P33241 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSP1P33241 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSP1P33241 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSP1P33241 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSP1P33241 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSP1P33241 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSP1P33241 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSP1P33241 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSP1P33241 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSP1P33241 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LSP1P33241 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSP1P33241 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSP1P33241 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSP1P33241 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSP1P33241 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSP1P33241 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSP1P33241 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSP1P33241 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSP1P33241 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSP1P33241 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSP1P33241 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSP1P33241 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSP1P33241 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSP1P33241 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSP1P33241 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSP1P33241 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSP1P33241 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSP1P33241 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSP1P33241 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LSP1P33241 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSP1P33241 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSP1P33241 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSP1P33241 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSP1P33241 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSP1P33241 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSP1P33241 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSP1P33241 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSP1P33241 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LSP1P33241 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSP1P33241 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSP1P33241 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSP1P33241 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSP1P33241 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSP1P33241 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LSP1P33241 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSP1P33241 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSP1P33241 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSP1P33241 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSP1P33241 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSP1P33241 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSP1P33241 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSP1P33241 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSP1P33241 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSP1P33241 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSP1P33241 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSP1P33241 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSP1P33241 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LSP1P33241 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSP1P33241 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSP1P33241 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSP1P33241 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSP1P33241 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSP1P33241 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSP1P33241 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSP1P33241 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSP1P33241 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSP1P33241 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LSP1P33241 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LSP1P33241 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSP1P33241 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSP1P33241 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSP1P33241 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSP1P33241 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSP1P33241 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSP1P33241 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSP1P33241 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSP1P33241 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSP1P33241 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSP1P33241 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSP1P33241 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSP1P33241 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSP1P33241 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms