Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DSG3P32926 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DSG3P32926 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DSG3P32926 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DSG3P32926 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG3P32926 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG3P32926 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG3P32926 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG3P32926 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG3P32926 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG3P32926 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG3P32926 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DSG3P32926 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DSG3P32926 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DSG3P32926 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DSG3P32926 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DSG3P32926 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DSG3P32926 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DSG3P32926 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DSG3P32926 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DSG3P32926 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DSG3P32926 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DSG3P32926 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DSG3P32926 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG3P32926 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG3P32926 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG3P32926 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG3P32926 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG3P32926 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG3P32926 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG3P32926 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG3P32926 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG3P32926 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG3P32926 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG3P32926 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG3P32926 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DSG3P32926 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DSG3P32926 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DSG3P32926 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DSG3P32926 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DSG3P32926 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DSG3P32926 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DSG3P32926 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DSG3P32926 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DSG3P32926 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DSG3P32926 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DSG3P32926 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DSG3P32926 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DSG3P32926 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DSG3P32926 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DSG3P32926 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DSG3P32926 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DSG3P32926 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DSG3P32926 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DSG3P32926 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DSG3P32926 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DSG3P32926 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DSG3P32926 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DSG3P32926 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DSG3P32926 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DSG3P32926 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DSG3P32926 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DSG3P32926 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DSG3P32926 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DSG3P32926 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DSG3P32926 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DSG3P32926 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DSG3P32926 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DSG3P32926 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DSG3P32926 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DSG3P32926 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DSG3P32926 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DSG3P32926 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DSG3P32926 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DSG3P32926 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DSG3P32926 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DSG3P32926 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DSG3P32926 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DSG3P32926 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DSG3P32926 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DSG3P32926 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DSG3P32926 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DSG3P32926 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DSG3P32926 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DSG3P32926 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DSG3P32926 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DSG3P32926 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DSG3P32926 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DSG3P32926 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DSG3P32926 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DSG3P32926 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DSG3P32926 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DSG3P32926 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
DSG3P32926 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DSG3P32926 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DSG3P32926 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DSG3P32926 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DSG3P32926 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DSG3P32926 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
DSG3P32926 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms