Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCKARP32238 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCKARP32238 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCKARP32238 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCKARP32238 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCKARP32238 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCKARP32238 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCKARP32238 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCKARP32238 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCKARP32238 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCKARP32238 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCKARP32238 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCKARP32238 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCKARP32238 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCKARP32238 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCKARP32238 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCKARP32238 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCKARP32238 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCKARP32238 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCKARP32238 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCKARP32238 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCKARP32238 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCKARP32238 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCKARP32238 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCKARP32238 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCKARP32238 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCKARP32238 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCKARP32238 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCKARP32238 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCKARP32238 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCKARP32238 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCKARP32238 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCKARP32238 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCKARP32238 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCKARP32238 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCKARP32238 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCKARP32238 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCKARP32238 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCKARP32238 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCKARP32238 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCKARP32238 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCKARP32238 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCKARP32238 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCKARP32238 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCKARP32238 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCKARP32238 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCKARP32238 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCKARP32238 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCKARP32238 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCKARP32238 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCKARP32238 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCKARP32238 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCKARP32238 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCKARP32238 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCKARP32238 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCKARP32238 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCKARP32238 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCKARP32238 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCKARP32238 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCKARP32238 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCKARP32238 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCKARP32238 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCKARP32238 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCKARP32238 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCKARP32238 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCKARP32238 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCKARP32238 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCKARP32238 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCKARP32238 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCKARP32238 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCKARP32238 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCKARP32238 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCKARP32238 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCKARP32238 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCKARP32238 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCKARP32238 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCKARP32238 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCKARP32238 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCKARP32238 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCKARP32238 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCKARP32238 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCKARP32238 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCKARP32238 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCKARP32238 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCKARP32238 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCKARP32238 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCKARP32238 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCKARP32238 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCKARP32238 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCKARP32238 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCKARP32238 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCKARP32238 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCKARP32238 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCKARP32238 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCKARP32238 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCKARP32238 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCKARP32238 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCKARP32238 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCKARP32238 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCKARP32238 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms