Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
L1CAMP32004 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
L1CAMP32004 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms