Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIPP30301 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIPP30301 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIPP30301 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MIPP30301 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIPP30301 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIPP30301 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIPP30301 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIPP30301 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIPP30301 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MIPP30301 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIPP30301 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIPP30301 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIPP30301 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIPP30301 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIPP30301 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIPP30301 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIPP30301 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIPP30301 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIPP30301 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIPP30301 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIPP30301 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIPP30301 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIPP30301 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIPP30301 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIPP30301 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIPP30301 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIPP30301 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIPP30301 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIPP30301 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIPP30301 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MIPP30301 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MIPP30301 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MIPP30301 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIPP30301 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIPP30301 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIPP30301 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MIPP30301 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIPP30301 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIPP30301 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIPP30301 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIPP30301 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIPP30301 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIPP30301 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIPP30301 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIPP30301 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIPP30301 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIPP30301 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIPP30301 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIPP30301 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIPP30301 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIPP30301 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIPP30301 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIPP30301 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIPP30301 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIPP30301 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIPP30301 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIPP30301 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIPP30301 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIPP30301 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIPP30301 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIPP30301 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIPP30301 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIPP30301 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIPP30301 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIPP30301 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIPP30301 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIPP30301 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MIPP30301 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MIPP30301 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIPP30301 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIPP30301 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MIPP30301 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MIPP30301 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MIPP30301 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MIPP30301 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MIPP30301 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MIPP30301 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MIPP30301 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MIPP30301 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MIPP30301 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MIPP30301 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MIPP30301 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MIPP30301 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MIPP30301 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MIPP30301 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MIPP30301 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MIPP30301 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MIPP30301 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MIPP30301 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MIPP30301 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MIPP30301 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MIPP30301 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MIPP30301 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MIPP30301 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MIPP30301 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MIPP30301 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MIPP30301 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MIPP30301 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MIPP30301 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms