Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHC1P29353 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHC1P29353 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHC1P29353 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHC1P29353 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHC1P29353 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHC1P29353 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHC1P29353 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHC1P29353 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHC1P29353 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SHC1P29353 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHC1P29353 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHC1P29353 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHC1P29353 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHC1P29353 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHC1P29353 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHC1P29353 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHC1P29353 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHC1P29353 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHC1P29353 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SHC1P29353 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHC1P29353 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHC1P29353 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHC1P29353 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHC1P29353 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHC1P29353 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHC1P29353 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHC1P29353 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SHC1P29353 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHC1P29353 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHC1P29353 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHC1P29353 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHC1P29353 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHC1P29353 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHC1P29353 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SHC1P29353 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHC1P29353 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHC1P29353 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHC1P29353 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHC1P29353 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHC1P29353 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHC1P29353 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHC1P29353 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SHC1P29353 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHC1P29353 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHC1P29353 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SHC1P29353 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHC1P29353 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHC1P29353 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHC1P29353 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHC1P29353 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHC1P29353 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHC1P29353 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHC1P29353 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHC1P29353 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHC1P29353 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHC1P29353 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHC1P29353 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHC1P29353 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHC1P29353 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHC1P29353 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHC1P29353 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHC1P29353 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHC1P29353 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHC1P29353 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHC1P29353 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHC1P29353 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHC1P29353 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHC1P29353 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHC1P29353 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHC1P29353 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHC1P29353 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHC1P29353 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHC1P29353 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHC1P29353 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SHC1P29353 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHC1P29353 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHC1P29353 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHC1P29353 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHC1P29353 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHC1P29353 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHC1P29353 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHC1P29353 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHC1P29353 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHC1P29353 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHC1P29353 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHC1P29353 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHC1P29353 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHC1P29353 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHC1P29353 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHC1P29353 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHC1P29353 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHC1P29353 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHC1P29353 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHC1P29353 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHC1P29353 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHC1P29353 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHC1P29353 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHC1P29353 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SHC1P29353 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243 ms