Protein–RNA interactions for Protein: P29350

PTPN6, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN6P29350 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN6P29350 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN6P29350 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms