Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJB2P29033 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJB2P29033 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB2P29033 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB2P29033 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB2P29033 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB2P29033 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB2P29033 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB2P29033 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB2P29033 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB2P29033 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB2P29033 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB2P29033 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB2P29033 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GJB2P29033 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJB2P29033 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJB2P29033 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJB2P29033 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJB2P29033 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJB2P29033 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJB2P29033 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJB2P29033 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GJB2P29033 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GJB2P29033 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJB2P29033 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJB2P29033 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJB2P29033 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJB2P29033 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJB2P29033 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJB2P29033 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJB2P29033 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJB2P29033 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJB2P29033 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJB2P29033 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJB2P29033 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GJB2P29033 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJB2P29033 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJB2P29033 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJB2P29033 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJB2P29033 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJB2P29033 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJB2P29033 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB2P29033 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB2P29033 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB2P29033 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB2P29033 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB2P29033 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB2P29033 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB2P29033 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB2P29033 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB2P29033 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB2P29033 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB2P29033 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB2P29033 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB2P29033 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJB2P29033 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJB2P29033 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJB2P29033 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB2P29033 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB2P29033 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB2P29033 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB2P29033 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB2P29033 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB2P29033 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB2P29033 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB2P29033 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB2P29033 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB2P29033 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJB2P29033 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJB2P29033 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJB2P29033 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJB2P29033 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJB2P29033 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJB2P29033 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJB2P29033 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GJB2P29033 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJB2P29033 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GJB2P29033 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GJB2P29033 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJB2P29033 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJB2P29033 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJB2P29033 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB2P29033 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB2P29033 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB2P29033 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB2P29033 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB2P29033 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB2P29033 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB2P29033 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB2P29033 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB2P29033 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB2P29033 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB2P29033 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB2P29033 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB2P29033 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB2P29033 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB2P29033 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB2P29033 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJB2P29033 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJB2P29033 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms