Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX2P28328 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX2P28328 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX2P28328 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX2P28328 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX2P28328 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX2P28328 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX2P28328 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX2P28328 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX2P28328 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX2P28328 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX2P28328 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX2P28328 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX2P28328 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX2P28328 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX2P28328 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX2P28328 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX2P28328 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX2P28328 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX2P28328 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX2P28328 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX2P28328 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX2P28328 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX2P28328 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX2P28328 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX2P28328 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX2P28328 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX2P28328 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX2P28328 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX2P28328 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX2P28328 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX2P28328 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX2P28328 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX2P28328 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX2P28328 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX2P28328 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX2P28328 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX2P28328 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX2P28328 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX2P28328 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX2P28328 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX2P28328 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX2P28328 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX2P28328 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX2P28328 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX2P28328 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX2P28328 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX2P28328 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX2P28328 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX2P28328 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX2P28328 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX2P28328 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX2P28328 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX2P28328 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX2P28328 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX2P28328 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX2P28328 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX2P28328 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX2P28328 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX2P28328 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX2P28328 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX2P28328 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX2P28328 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX2P28328 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX2P28328 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX2P28328 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX2P28328 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX2P28328 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX2P28328 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX2P28328 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX2P28328 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX2P28328 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX2P28328 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX2P28328 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX2P28328 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX2P28328 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX2P28328 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX2P28328 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX2P28328 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX2P28328 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX2P28328 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX2P28328 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX2P28328 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX2P28328 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX2P28328 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX2P28328 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX2P28328 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX2P28328 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX2P28328 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX2P28328 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX2P28328 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX2P28328 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX2P28328 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX2P28328 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX2P28328 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX2P28328 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX2P28328 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX2P28328 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX2P28328 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX2P28328 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms