Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTFP26441 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTFP26441 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTFP26441 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTFP26441 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTFP26441 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNTFP26441 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNTFP26441 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTFP26441 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTFP26441 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTFP26441 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTFP26441 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTFP26441 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTFP26441 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTFP26441 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTFP26441 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTFP26441 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTFP26441 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTFP26441 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTFP26441 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTFP26441 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTFP26441 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTFP26441 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTFP26441 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTFP26441 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTFP26441 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTFP26441 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTFP26441 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTFP26441 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTFP26441 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTFP26441 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTFP26441 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTFP26441 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTFP26441 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTFP26441 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTFP26441 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTFP26441 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTFP26441 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTFP26441 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTFP26441 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTFP26441 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTFP26441 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTFP26441 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTFP26441 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTFP26441 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTFP26441 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTFP26441 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTFP26441 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTFP26441 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTFP26441 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTFP26441 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTFP26441 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTFP26441 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTFP26441 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTFP26441 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTFP26441 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTFP26441 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTFP26441 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTFP26441 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTFP26441 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTFP26441 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTFP26441 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTFP26441 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTFP26441 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTFP26441 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTFP26441 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTFP26441 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTFP26441 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTFP26441 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTFP26441 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTFP26441 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTFP26441 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTFP26441 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTFP26441 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTFP26441 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTFP26441 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTFP26441 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTFP26441 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTFP26441 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTFP26441 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTFP26441 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTFP26441 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTFP26441 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTFP26441 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTFP26441 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTFP26441 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTFP26441 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTFP26441 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTFP26441 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTFP26441 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTFP26441 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTFP26441 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTFP26441 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTFP26441 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTFP26441 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTFP26441 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTFP26441 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTFP26441 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTFP26441 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTFP26441 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms