Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IVDP26440 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IVDP26440 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IVDP26440 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IVDP26440 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IVDP26440 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IVDP26440 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IVDP26440 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IVDP26440 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IVDP26440 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IVDP26440 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IVDP26440 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IVDP26440 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IVDP26440 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IVDP26440 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IVDP26440 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IVDP26440 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IVDP26440 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IVDP26440 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IVDP26440 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IVDP26440 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IVDP26440 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IVDP26440 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IVDP26440 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IVDP26440 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IVDP26440 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IVDP26440 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IVDP26440 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IVDP26440 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IVDP26440 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IVDP26440 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IVDP26440 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IVDP26440 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IVDP26440 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IVDP26440 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IVDP26440 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IVDP26440 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IVDP26440 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IVDP26440 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IVDP26440 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IVDP26440 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IVDP26440 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IVDP26440 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IVDP26440 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IVDP26440 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IVDP26440 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IVDP26440 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IVDP26440 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IVDP26440 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IVDP26440 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IVDP26440 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IVDP26440 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IVDP26440 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IVDP26440 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IVDP26440 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IVDP26440 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IVDP26440 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IVDP26440 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IVDP26440 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IVDP26440 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IVDP26440 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IVDP26440 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IVDP26440 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IVDP26440 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IVDP26440 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IVDP26440 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IVDP26440 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IVDP26440 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IVDP26440 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IVDP26440 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IVDP26440 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IVDP26440 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IVDP26440 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IVDP26440 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IVDP26440 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IVDP26440 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IVDP26440 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IVDP26440 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IVDP26440 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IVDP26440 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IVDP26440 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IVDP26440 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IVDP26440 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IVDP26440 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IVDP26440 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IVDP26440 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IVDP26440 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IVDP26440 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IVDP26440 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IVDP26440 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IVDP26440 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IVDP26440 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IVDP26440 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IVDP26440 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IVDP26440 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IVDP26440 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IVDP26440 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IVDP26440 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IVDP26440 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IVDP26440 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms