Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMLP26374 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMLP26374 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMLP26374 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMLP26374 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMLP26374 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMLP26374 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMLP26374 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMLP26374 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMLP26374 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMLP26374 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMLP26374 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMLP26374 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMLP26374 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMLP26374 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMLP26374 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMLP26374 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMLP26374 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMLP26374 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMLP26374 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMLP26374 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMLP26374 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMLP26374 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMLP26374 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMLP26374 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMLP26374 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMLP26374 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMLP26374 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMLP26374 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHMLP26374 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHMLP26374 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMLP26374 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMLP26374 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMLP26374 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMLP26374 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMLP26374 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMLP26374 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMLP26374 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMLP26374 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMLP26374 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMLP26374 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMLP26374 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMLP26374 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMLP26374 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMLP26374 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMLP26374 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMLP26374 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMLP26374 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMLP26374 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMLP26374 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMLP26374 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMLP26374 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMLP26374 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMLP26374 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMLP26374 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMLP26374 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMLP26374 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMLP26374 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMLP26374 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHMLP26374 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHMLP26374 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHMLP26374 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMLP26374 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMLP26374 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMLP26374 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMLP26374 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMLP26374 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMLP26374 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMLP26374 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMLP26374 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMLP26374 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMLP26374 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMLP26374 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMLP26374 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMLP26374 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMLP26374 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMLP26374 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMLP26374 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMLP26374 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMLP26374 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMLP26374 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMLP26374 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMLP26374 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMLP26374 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMLP26374 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMLP26374 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMLP26374 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMLP26374 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMLP26374 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMLP26374 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMLP26374 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMLP26374 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMLP26374 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMLP26374 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMLP26374 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMLP26374 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMLP26374 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMLP26374 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMLP26374 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMLP26374 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms