Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL13P26373 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL13P26373 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL13P26373 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL13P26373 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL13P26373 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL13P26373 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL13P26373 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL13P26373 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL13P26373 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL13P26373 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL13P26373 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL13P26373 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL13P26373 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL13P26373 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL13P26373 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL13P26373 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPL13P26373 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL13P26373 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL13P26373 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL13P26373 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL13P26373 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL13P26373 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL13P26373 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL13P26373 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL13P26373 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL13P26373 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL13P26373 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL13P26373 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL13P26373 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL13P26373 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL13P26373 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL13P26373 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL13P26373 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL13P26373 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL13P26373 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL13P26373 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL13P26373 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL13P26373 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL13P26373 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL13P26373 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL13P26373 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL13P26373 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL13P26373 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL13P26373 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL13P26373 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL13P26373 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL13P26373 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL13P26373 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL13P26373 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL13P26373 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL13P26373 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL13P26373 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL13P26373 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL13P26373 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL13P26373 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL13P26373 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL13P26373 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL13P26373 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL13P26373 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL13P26373 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL13P26373 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPL13P26373 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL13P26373 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL13P26373 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL13P26373 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL13P26373 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL13P26373 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL13P26373 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL13P26373 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL13P26373 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL13P26373 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL13P26373 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL13P26373 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL13P26373 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL13P26373 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL13P26373 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL13P26373 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL13P26373 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL13P26373 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL13P26373 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL13P26373 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL13P26373 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL13P26373 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL13P26373 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL13P26373 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL13P26373 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL13P26373 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL13P26373 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL13P26373 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL13P26373 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL13P26373 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL13P26373 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL13P26373 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL13P26373 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL13P26373 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL13P26373 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL13P26373 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL13P26373 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL13P26373 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms