Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME2P23368 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME2P23368 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME2P23368 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME2P23368 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME2P23368 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME2P23368 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ME2P23368 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME2P23368 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME2P23368 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME2P23368 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME2P23368 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME2P23368 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME2P23368 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME2P23368 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME2P23368 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME2P23368 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME2P23368 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME2P23368 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME2P23368 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME2P23368 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME2P23368 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME2P23368 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME2P23368 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME2P23368 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME2P23368 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME2P23368 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME2P23368 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME2P23368 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME2P23368 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME2P23368 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME2P23368 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME2P23368 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ME2P23368 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ME2P23368 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME2P23368 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME2P23368 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME2P23368 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME2P23368 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME2P23368 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME2P23368 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME2P23368 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME2P23368 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME2P23368 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME2P23368 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME2P23368 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME2P23368 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME2P23368 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME2P23368 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME2P23368 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME2P23368 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME2P23368 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME2P23368 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME2P23368 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME2P23368 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ME2P23368 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME2P23368 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME2P23368 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ME2P23368 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME2P23368 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME2P23368 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME2P23368 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME2P23368 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME2P23368 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME2P23368 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME2P23368 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ME2P23368 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME2P23368 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME2P23368 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME2P23368 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME2P23368 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME2P23368 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME2P23368 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME2P23368 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME2P23368 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME2P23368 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME2P23368 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME2P23368 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME2P23368 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ME2P23368 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME2P23368 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME2P23368 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME2P23368 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME2P23368 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME2P23368 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME2P23368 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME2P23368 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME2P23368 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME2P23368 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME2P23368 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME2P23368 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME2P23368 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME2P23368 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME2P23368 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME2P23368 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME2P23368 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME2P23368 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME2P23368 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME2P23368 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME2P23368 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms