Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCP2P22307 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCP2P22307 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCP2P22307 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SCP2P22307 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCP2P22307 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCP2P22307 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCP2P22307 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCP2P22307 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCP2P22307 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCP2P22307 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCP2P22307 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCP2P22307 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SCP2P22307 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SCP2P22307 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCP2P22307 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCP2P22307 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCP2P22307 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCP2P22307 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCP2P22307 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCP2P22307 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCP2P22307 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCP2P22307 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCP2P22307 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCP2P22307 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCP2P22307 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCP2P22307 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCP2P22307 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCP2P22307 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCP2P22307 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCP2P22307 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCP2P22307 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCP2P22307 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCP2P22307 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCP2P22307 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCP2P22307 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCP2P22307 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCP2P22307 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCP2P22307 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCP2P22307 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCP2P22307 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCP2P22307 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCP2P22307 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCP2P22307 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCP2P22307 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCP2P22307 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SCP2P22307 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCP2P22307 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SCP2P22307 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCP2P22307 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCP2P22307 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCP2P22307 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCP2P22307 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCP2P22307 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCP2P22307 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCP2P22307 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCP2P22307 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCP2P22307 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCP2P22307 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCP2P22307 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SCP2P22307 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCP2P22307 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCP2P22307 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCP2P22307 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCP2P22307 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCP2P22307 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCP2P22307 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCP2P22307 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCP2P22307 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCP2P22307 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCP2P22307 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCP2P22307 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCP2P22307 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCP2P22307 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCP2P22307 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCP2P22307 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCP2P22307 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCP2P22307 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCP2P22307 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCP2P22307 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCP2P22307 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCP2P22307 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCP2P22307 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCP2P22307 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCP2P22307 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCP2P22307 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCP2P22307 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCP2P22307 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCP2P22307 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCP2P22307 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCP2P22307 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCP2P22307 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCP2P22307 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCP2P22307 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCP2P22307 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCP2P22307 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCP2P22307 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCP2P22307 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SCP2P22307 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCP2P22307 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms