Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PCMT1P22061 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms