Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA5P20719 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms