Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LBPP18428 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LBPP18428 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LBPP18428 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LBPP18428 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LBPP18428 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LBPP18428 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LBPP18428 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LBPP18428 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LBPP18428 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LBPP18428 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LBPP18428 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LBPP18428 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LBPP18428 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LBPP18428 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LBPP18428 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LBPP18428 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LBPP18428 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBPP18428 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBPP18428 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBPP18428 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBPP18428 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LBPP18428 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBPP18428 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBPP18428 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBPP18428 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBPP18428 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBPP18428 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBPP18428 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBPP18428 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBPP18428 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBPP18428 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBPP18428 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBPP18428 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBPP18428 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LBPP18428 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBPP18428 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBPP18428 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBPP18428 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBPP18428 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBPP18428 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBPP18428 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBPP18428 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBPP18428 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBPP18428 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBPP18428 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBPP18428 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBPP18428 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBPP18428 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBPP18428 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBPP18428 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBPP18428 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBPP18428 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBPP18428 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBPP18428 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBPP18428 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBPP18428 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBPP18428 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBPP18428 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBPP18428 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBPP18428 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBPP18428 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LBPP18428 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LBPP18428 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LBPP18428 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LBPP18428 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LBPP18428 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LBPP18428 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LBPP18428 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LBPP18428 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LBPP18428 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LBPP18428 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LBPP18428 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LBPP18428 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LBPP18428 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LBPP18428 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LBPP18428 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LBPP18428 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LBPP18428 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LBPP18428 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LBPP18428 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LBPP18428 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LBPP18428 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LBPP18428 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LBPP18428 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LBPP18428 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LBPP18428 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LBPP18428 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LBPP18428 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LBPP18428 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LBPP18428 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LBPP18428 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LBPP18428 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LBPP18428 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LBPP18428 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LBPP18428 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LBPP18428 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LBPP18428 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LBPP18428 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LBPP18428 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms