Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FLT1P17948 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FLT1P17948 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FLT1P17948 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FLT1P17948 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FLT1P17948 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FLT1P17948 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FLT1P17948 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FLT1P17948 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FLT1P17948 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FLT1P17948 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FLT1P17948 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FLT1P17948 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FLT1P17948 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FLT1P17948 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FLT1P17948 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
FLT1P17948 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FLT1P17948 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FLT1P17948 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FLT1P17948 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FLT1P17948 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FLT1P17948 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FLT1P17948 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FLT1P17948 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FLT1P17948 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FLT1P17948 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FLT1P17948 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FLT1P17948 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FLT1P17948 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FLT1P17948 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FLT1P17948 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FLT1P17948 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FLT1P17948 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FLT1P17948 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FLT1P17948 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FLT1P17948 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FLT1P17948 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FLT1P17948 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FLT1P17948 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FLT1P17948 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FLT1P17948 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FLT1P17948 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FLT1P17948 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FLT1P17948 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FLT1P17948 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FLT1P17948 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FLT1P17948 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FLT1P17948 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FLT1P17948 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FLT1P17948 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FLT1P17948 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FLT1P17948 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FLT1P17948 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FLT1P17948 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FLT1P17948 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FLT1P17948 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FLT1P17948 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FLT1P17948 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FLT1P17948 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FLT1P17948 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FLT1P17948 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FLT1P17948 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FLT1P17948 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FLT1P17948 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FLT1P17948 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FLT1P17948 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FLT1P17948 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FLT1P17948 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FLT1P17948 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FLT1P17948 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FLT1P17948 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FLT1P17948 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FLT1P17948 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FLT1P17948 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FLT1P17948 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FLT1P17948 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FLT1P17948 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FLT1P17948 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FLT1P17948 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FLT1P17948 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FLT1P17948 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FLT1P17948 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FLT1P17948 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FLT1P17948 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FLT1P17948 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FLT1P17948 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FLT1P17948 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FLT1P17948 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FLT1P17948 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FLT1P17948 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FLT1P17948 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FLT1P17948 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FLT1P17948 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FLT1P17948 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FLT1P17948 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FLT1P17948 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FLT1P17948 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FLT1P17948 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FLT1P17948 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FLT1P17948 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms