Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN2P17655 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN2P17655 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms