Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE6AP16499 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE6AP16499 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE6AP16499 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE6AP16499 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE6AP16499 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE6AP16499 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE6AP16499 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE6AP16499 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE6AP16499 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE6AP16499 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE6AP16499 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE6AP16499 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms