Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF4P15884 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF4P15884 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF4P15884 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF4P15884 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF4P15884 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF4P15884 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF4P15884 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF4P15884 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF4P15884 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF4P15884 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF4P15884 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF4P15884 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF4P15884 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF4P15884 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF4P15884 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF4P15884 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF4P15884 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF4P15884 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF4P15884 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF4P15884 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF4P15884 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF4P15884 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF4P15884 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF4P15884 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF4P15884 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF4P15884 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF4P15884 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF4P15884 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF4P15884 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF4P15884 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF4P15884 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF4P15884 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF4P15884 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF4P15884 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF4P15884 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF4P15884 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF4P15884 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF4P15884 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF4P15884 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF4P15884 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF4P15884 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF4P15884 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF4P15884 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF4P15884 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF4P15884 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF4P15884 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF4P15884 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF4P15884 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF4P15884 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF4P15884 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF4P15884 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF4P15884 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF4P15884 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF4P15884 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF4P15884 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF4P15884 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF4P15884 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF4P15884 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF4P15884 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF4P15884 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCF4P15884 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCF4P15884 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCF4P15884 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCF4P15884 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCF4P15884 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCF4P15884 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCF4P15884 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF4P15884 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF4P15884 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF4P15884 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF4P15884 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF4P15884 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF4P15884 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF4P15884 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF4P15884 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF4P15884 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF4P15884 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF4P15884 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF4P15884 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF4P15884 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF4P15884 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF4P15884 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF4P15884 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF4P15884 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF4P15884 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF4P15884 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF4P15884 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF4P15884 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF4P15884 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF4P15884 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF4P15884 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF4P15884 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF4P15884 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF4P15884 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF4P15884 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF4P15884 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF4P15884 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCF4P15884 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TCF4P15884 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms