Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UCHL3P15374 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UCHL3P15374 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UCHL3P15374 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms