Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SLC5A1P13866 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC5A1P13866 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms