Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT13P13646 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT13P13646 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT13P13646 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT13P13646 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT13P13646 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT13P13646 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT13P13646 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT13P13646 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT13P13646 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT13P13646 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT13P13646 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT13P13646 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT13P13646 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT13P13646 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT13P13646 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT13P13646 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT13P13646 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT13P13646 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT13P13646 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT13P13646 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT13P13646 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT13P13646 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT13P13646 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT13P13646 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT13P13646 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT13P13646 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT13P13646 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT13P13646 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT13P13646 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT13P13646 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT13P13646 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT13P13646 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT13P13646 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT13P13646 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT13P13646 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT13P13646 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT13P13646 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT13P13646 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT13P13646 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT13P13646 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT13P13646 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT13P13646 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT13P13646 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT13P13646 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT13P13646 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT13P13646 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT13P13646 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT13P13646 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT13P13646 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT13P13646 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT13P13646 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT13P13646 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT13P13646 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT13P13646 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT13P13646 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT13P13646 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT13P13646 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT13P13646 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT13P13646 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT13P13646 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT13P13646 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT13P13646 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT13P13646 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT13P13646 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT13P13646 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT13P13646 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT13P13646 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT13P13646 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT13P13646 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT13P13646 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT13P13646 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT13P13646 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT13P13646 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT13P13646 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT13P13646 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT13P13646 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT13P13646 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT13P13646 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT13P13646 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT13P13646 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT13P13646 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT13P13646 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT13P13646 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT13P13646 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT13P13646 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT13P13646 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT13P13646 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT13P13646 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT13P13646 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT13P13646 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT13P13646 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT13P13646 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT13P13646 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT13P13646 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT13P13646 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT13P13646 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT13P13646 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT13P13646 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT13P13646 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms