Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGA4P13612 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA4P13612 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA4P13612 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms