Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL4P13236 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL4P13236 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL4P13236 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL4P13236 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL4P13236 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL4P13236 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL4P13236 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL4P13236 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL4P13236 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL4P13236 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL4P13236 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL4P13236 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL4P13236 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL4P13236 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL4P13236 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL4P13236 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL4P13236 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL4P13236 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL4P13236 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL4P13236 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL4P13236 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL4P13236 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL4P13236 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL4P13236 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL4P13236 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL4P13236 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL4P13236 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL4P13236 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL4P13236 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL4P13236 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL4P13236 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL4P13236 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL4P13236 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL4P13236 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL4P13236 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL4P13236 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL4P13236 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL4P13236 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL4P13236 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL4P13236 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL4P13236 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL4P13236 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL4P13236 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL4P13236 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL4P13236 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL4P13236 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL4P13236 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL4P13236 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL4P13236 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL4P13236 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL4P13236 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL4P13236 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL4P13236 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4P13236 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4P13236 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4P13236 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4P13236 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4P13236 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4P13236 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL4P13236 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL4P13236 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4P13236 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4P13236 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4P13236 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4P13236 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4P13236 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4P13236 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4P13236 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4P13236 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL4P13236 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL4P13236 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL4P13236 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL4P13236 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL4P13236 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL4P13236 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL4P13236 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL4P13236 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL4P13236 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL4P13236 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL4P13236 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL4P13236 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL4P13236 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4P13236 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4P13236 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4P13236 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4P13236 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4P13236 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4P13236 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4P13236 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4P13236 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4P13236 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCL4P13236 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4P13236 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4P13236 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4P13236 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4P13236 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4P13236 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4P13236 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4P13236 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms