Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NR2C1P13056 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2C1P13056 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NR2C1P13056 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR2C1P13056 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR2C1P13056 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR2C1P13056 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR2C1P13056 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR2C1P13056 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2C1P13056 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2C1P13056 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2C1P13056 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2C1P13056 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2C1P13056 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2C1P13056 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms