Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH1P12830 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH1P12830 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH1P12830 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH1P12830 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH1P12830 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH1P12830 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH1P12830 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH1P12830 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH1P12830 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH1P12830 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH1P12830 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH1P12830 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH1P12830 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH1P12830 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH1P12830 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH1P12830 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH1P12830 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH1P12830 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH1P12830 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH1P12830 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH1P12830 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH1P12830 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH1P12830 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH1P12830 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH1P12830 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH1P12830 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH1P12830 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH1P12830 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH1P12830 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH1P12830 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH1P12830 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH1P12830 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH1P12830 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH1P12830 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH1P12830 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH1P12830 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH1P12830 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH1P12830 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH1P12830 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH1P12830 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH1P12830 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH1P12830 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH1P12830 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH1P12830 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH1P12830 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH1P12830 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH1P12830 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH1P12830 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH1P12830 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH1P12830 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH1P12830 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH1P12830 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH1P12830 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH1P12830 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH1P12830 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH1P12830 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH1P12830 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH1P12830 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH1P12830 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH1P12830 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH1P12830 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH1P12830 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH1P12830 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH1P12830 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH1P12830 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH1P12830 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH1P12830 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH1P12830 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH1P12830 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH1P12830 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH1P12830 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH1P12830 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH1P12830 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH1P12830 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH1P12830 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH1P12830 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH1P12830 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH1P12830 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH1P12830 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH1P12830 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH1P12830 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH1P12830 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH1P12830 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH1P12830 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH1P12830 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH1P12830 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH1P12830 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH1P12830 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH1P12830 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH1P12830 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH1P12830 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH1P12830 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH1P12830 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH1P12830 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH1P12830 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH1P12830 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH1P12830 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH1P12830 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH1P12830 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms