Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
RLBP1P12271 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RLBP1P12271 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RLBP1P12271 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms