Protein–RNA interactions for Protein: P11217

PYGM, Glycogen phosphorylase, muscle form, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGMP11217 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PYGMP11217 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PYGMP11217 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PYGMP11217 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PYGMP11217 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PYGMP11217 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PYGMP11217 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PYGMP11217 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PYGMP11217 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PYGMP11217 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PYGMP11217 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PYGMP11217 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PYGMP11217 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PYGMP11217 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PYGMP11217 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PYGMP11217 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PYGMP11217 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PYGMP11217 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PYGMP11217 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PYGMP11217 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PYGMP11217 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PYGMP11217 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PYGMP11217 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYGMP11217 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYGMP11217 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYGMP11217 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYGMP11217 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PYGMP11217 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PYGMP11217 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PYGMP11217 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PYGMP11217 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PYGMP11217 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PYGMP11217 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYGMP11217 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYGMP11217 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYGMP11217 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYGMP11217 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYGMP11217 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYGMP11217 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYGMP11217 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGMP11217 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGMP11217 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGMP11217 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGMP11217 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGMP11217 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGMP11217 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGMP11217 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGMP11217 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGMP11217 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGMP11217 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PYGMP11217 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYGMP11217 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYGMP11217 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYGMP11217 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYGMP11217 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYGMP11217 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYGMP11217 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYGMP11217 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYGMP11217 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYGMP11217 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PYGMP11217 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYGMP11217 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYGMP11217 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYGMP11217 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYGMP11217 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYGMP11217 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYGMP11217 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYGMP11217 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYGMP11217 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYGMP11217 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYGMP11217 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYGMP11217 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYGMP11217 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PYGMP11217 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYGMP11217 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYGMP11217 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PYGMP11217 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PYGMP11217 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PYGMP11217 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PYGMP11217 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PYGMP11217 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PYGMP11217 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PYGMP11217 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PYGMP11217 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PYGMP11217 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PYGMP11217 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PYGMP11217 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PYGMP11217 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PYGMP11217 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PYGMP11217 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PYGMP11217 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PYGMP11217 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PYGMP11217 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PYGMP11217 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PYGMP11217 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PYGMP11217 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PYGMP11217 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PYGMP11217 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PYGMP11217 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PYGMP11217 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms