Protein–RNA interactions for Protein: P10619

CTSA, Lysosomal protective protein, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSAP10619 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTSAP10619 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTSAP10619 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTSAP10619 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTSAP10619 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSAP10619 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSAP10619 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSAP10619 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSAP10619 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSAP10619 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSAP10619 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSAP10619 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTSAP10619 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTSAP10619 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTSAP10619 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTSAP10619 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTSAP10619 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTSAP10619 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTSAP10619 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSAP10619 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSAP10619 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSAP10619 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSAP10619 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSAP10619 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSAP10619 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSAP10619 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSAP10619 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSAP10619 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSAP10619 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSAP10619 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSAP10619 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSAP10619 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSAP10619 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSAP10619 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSAP10619 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSAP10619 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSAP10619 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSAP10619 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSAP10619 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTSAP10619 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTSAP10619 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTSAP10619 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTSAP10619 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTSAP10619 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSAP10619 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSAP10619 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSAP10619 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSAP10619 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSAP10619 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSAP10619 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSAP10619 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSAP10619 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CTSAP10619 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTSAP10619 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTSAP10619 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTSAP10619 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTSAP10619 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTSAP10619 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTSAP10619 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTSAP10619 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTSAP10619 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTSAP10619 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTSAP10619 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTSAP10619 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTSAP10619 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTSAP10619 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTSAP10619 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTSAP10619 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTSAP10619 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTSAP10619 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTSAP10619 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTSAP10619 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTSAP10619 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTSAP10619 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSAP10619 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSAP10619 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSAP10619 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSAP10619 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSAP10619 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSAP10619 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSAP10619 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSAP10619 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSAP10619 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSAP10619 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSAP10619 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSAP10619 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSAP10619 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSAP10619 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSAP10619 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSAP10619 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTSAP10619 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTSAP10619 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTSAP10619 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTSAP10619 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CTSAP10619 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTSAP10619 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTSAP10619 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTSAP10619 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTSAP10619 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTSAP10619 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms