Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIMD1P0DJR0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIMD1P0DJR0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIMD1P0DJR0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GIMD1P0DJR0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIMD1P0DJR0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIMD1P0DJR0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms