Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM13P0DJ93 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM13P0DJ93 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms