Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRR35P0CG20 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRR35P0CG20 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRR35P0CG20 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms