Protein–RNA interactions for Protein: P0C264

SBK3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK3P0C264 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SBK3P0C264 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK3P0C264 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK3P0C264 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms