Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
C4BP0C0L5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
C4BP0C0L5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
C4BP0C0L5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms