Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRCP08575 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
PTPRCP08575 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRCP08575 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
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