Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOP08100 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RHOP08100 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOP08100 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOP08100 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOP08100 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOP08100 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOP08100 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOP08100 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOP08100 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOP08100 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOP08100 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOP08100 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOP08100 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOP08100 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOP08100 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOP08100 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOP08100 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOP08100 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOP08100 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOP08100 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOP08100 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOP08100 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOP08100 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOP08100 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOP08100 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOP08100 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOP08100 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOP08100 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOP08100 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOP08100 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOP08100 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOP08100 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOP08100 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOP08100 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOP08100 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOP08100 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOP08100 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOP08100 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOP08100 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOP08100 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOP08100 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOP08100 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOP08100 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOP08100 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOP08100 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOP08100 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOP08100 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOP08100 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOP08100 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOP08100 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOP08100 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOP08100 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOP08100 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RHOP08100 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOP08100 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOP08100 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOP08100 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOP08100 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOP08100 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOP08100 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOP08100 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOP08100 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOP08100 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOP08100 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOP08100 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOP08100 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOP08100 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOP08100 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOP08100 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOP08100 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOP08100 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOP08100 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOP08100 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOP08100 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOP08100 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOP08100 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOP08100 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOP08100 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOP08100 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOP08100 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOP08100 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RHOP08100 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOP08100 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOP08100 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOP08100 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOP08100 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOP08100 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOP08100 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOP08100 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOP08100 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOP08100 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOP08100 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOP08100 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOP08100 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOP08100 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOP08100 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOP08100 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOP08100 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOP08100 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms