Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LPLP06858 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LPLP06858 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LPLP06858 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPLP06858 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPLP06858 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPLP06858 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPLP06858 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPLP06858 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPLP06858 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPLP06858 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPLP06858 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPLP06858 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPLP06858 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPLP06858 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPLP06858 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPLP06858 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPLP06858 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPLP06858 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPLP06858 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPLP06858 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPLP06858 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPLP06858 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPLP06858 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LPLP06858 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPLP06858 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPLP06858 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPLP06858 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LPLP06858 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LPLP06858 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LPLP06858 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LPLP06858 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LPLP06858 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LPLP06858 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LPLP06858 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LPLP06858 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LPLP06858 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LPLP06858 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LPLP06858 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LPLP06858 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LPLP06858 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LPLP06858 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LPLP06858 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LPLP06858 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LPLP06858 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LPLP06858 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LPLP06858 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LPLP06858 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LPLP06858 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LPLP06858 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LPLP06858 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LPLP06858 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LPLP06858 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LPLP06858 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LPLP06858 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LPLP06858 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LPLP06858 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LPLP06858 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LPLP06858 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LPLP06858 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LPLP06858 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LPLP06858 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LPLP06858 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LPLP06858 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LPLP06858 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LPLP06858 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LPLP06858 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LPLP06858 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms