Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGRP06401 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGRP06401 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGRP06401 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGRP06401 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGRP06401 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGRP06401 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGRP06401 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGRP06401 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGRP06401 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGRP06401 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGRP06401 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGRP06401 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGRP06401 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGRP06401 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGRP06401 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PGRP06401 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGRP06401 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGRP06401 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGRP06401 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGRP06401 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGRP06401 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGRP06401 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGRP06401 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGRP06401 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGRP06401 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGRP06401 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGRP06401 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGRP06401 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGRP06401 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGRP06401 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGRP06401 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGRP06401 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGRP06401 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGRP06401 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGRP06401 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGRP06401 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGRP06401 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGRP06401 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGRP06401 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGRP06401 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGRP06401 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PGRP06401 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGRP06401 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGRP06401 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGRP06401 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGRP06401 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGRP06401 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGRP06401 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGRP06401 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGRP06401 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGRP06401 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGRP06401 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGRP06401 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGRP06401 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGRP06401 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGRP06401 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGRP06401 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGRP06401 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGRP06401 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PGRP06401 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGRP06401 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGRP06401 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGRP06401 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGRP06401 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGRP06401 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PGRP06401 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGRP06401 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGRP06401 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGRP06401 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGRP06401 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGRP06401 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGRP06401 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGRP06401 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PGRP06401 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGRP06401 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGRP06401 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGRP06401 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGRP06401 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGRP06401 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGRP06401 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGRP06401 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGRP06401 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGRP06401 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGRP06401 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGRP06401 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGRP06401 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGRP06401 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGRP06401 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGRP06401 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGRP06401 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGRP06401 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGRP06401 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PGRP06401 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PGRP06401 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGRP06401 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGRP06401 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGRP06401 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGRP06401 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGRP06401 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms