Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFAP2AP05549 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAP2AP05549 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAP2AP05549 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms