Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYCNP04198 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYCNP04198 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYCNP04198 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYCNP04198 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYCNP04198 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYCNP04198 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYCNP04198 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYCNP04198 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYCNP04198 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYCNP04198 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYCNP04198 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYCNP04198 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYCNP04198 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYCNP04198 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYCNP04198 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYCNP04198 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYCNP04198 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYCNP04198 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYCNP04198 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYCNP04198 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYCNP04198 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYCNP04198 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYCNP04198 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MYCNP04198 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYCNP04198 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYCNP04198 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYCNP04198 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYCNP04198 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYCNP04198 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYCNP04198 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYCNP04198 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYCNP04198 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MYCNP04198 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MYCNP04198 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MYCNP04198 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MYCNP04198 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYCNP04198 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYCNP04198 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MYCNP04198 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYCNP04198 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYCNP04198 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYCNP04198 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYCNP04198 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYCNP04198 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MYCNP04198 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYCNP04198 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYCNP04198 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MYCNP04198 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MYCNP04198 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYCNP04198 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYCNP04198 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYCNP04198 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYCNP04198 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYCNP04198 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYCNP04198 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYCNP04198 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYCNP04198 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYCNP04198 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYCNP04198 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYCNP04198 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYCNP04198 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYCNP04198 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYCNP04198 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYCNP04198 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYCNP04198 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYCNP04198 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYCNP04198 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYCNP04198 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYCNP04198 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYCNP04198 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYCNP04198 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYCNP04198 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYCNP04198 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYCNP04198 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYCNP04198 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYCNP04198 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYCNP04198 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYCNP04198 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYCNP04198 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYCNP04198 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYCNP04198 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYCNP04198 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYCNP04198 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYCNP04198 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYCNP04198 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYCNP04198 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYCNP04198 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYCNP04198 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYCNP04198 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYCNP04198 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYCNP04198 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYCNP04198 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYCNP04198 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYCNP04198 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYCNP04198 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYCNP04198 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYCNP04198 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYCNP04198 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYCNP04198 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms