Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ESR1P03372 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ESR1P03372 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ESR1P03372 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ESR1P03372 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ESR1P03372 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ESR1P03372 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ESR1P03372 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ESR1P03372 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ESR1P03372 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ESR1P03372 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ESR1P03372 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ESR1P03372 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ESR1P03372 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ESR1P03372 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ESR1P03372 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ESR1P03372 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ESR1P03372 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ESR1P03372 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ESR1P03372 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ESR1P03372 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ESR1P03372 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ESR1P03372 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ESR1P03372 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ESR1P03372 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ESR1P03372 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ESR1P03372 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ESR1P03372 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ESR1P03372 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ESR1P03372 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ESR1P03372 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ESR1P03372 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ESR1P03372 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ESR1P03372 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ESR1P03372 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ESR1P03372 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ESR1P03372 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ESR1P03372 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ESR1P03372 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ESR1P03372 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ESR1P03372 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESR1P03372 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESR1P03372 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESR1P03372 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESR1P03372 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESR1P03372 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESR1P03372 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESR1P03372 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESR1P03372 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESR1P03372 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESR1P03372 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ESR1P03372 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ESR1P03372 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ESR1P03372 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ESR1P03372 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESR1P03372 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESR1P03372 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ESR1P03372 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESR1P03372 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESR1P03372 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESR1P03372 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESR1P03372 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESR1P03372 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESR1P03372 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ESR1P03372 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ESR1P03372 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ESR1P03372 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ESR1P03372 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ESR1P03372 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ESR1P03372 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ESR1P03372 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ESR1P03372 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESR1P03372 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESR1P03372 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESR1P03372 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESR1P03372 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESR1P03372 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESR1P03372 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESR1P03372 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESR1P03372 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESR1P03372 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESR1P03372 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESR1P03372 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ESR1P03372 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ESR1P03372 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ESR1P03372 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ESR1P03372 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ESR1P03372 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ESR1P03372 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ESR1P03372 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ESR1P03372 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ESR1P03372 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ESR1P03372 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ESR1P03372 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ESR1P03372 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ESR1P03372 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ESR1P03372 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ESR1P03372 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ESR1P03372 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ESR1P03372 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms