Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A1P02730 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms